Malin Lindqvist Appell

Avhandling: Pharmacogenetics of thiopurines with focus on thiopurine methyltransferase.

Jag heter Malin Lindqvist Appell och är forskarassistent på avdelningen för läkemedelsforskning/klinisk farmakologi. Min forskning rör sig inom området farmakogenetik.

Det är väl känt att läkemedel kan ha mycket olika effekter på patienter med samma sjukdom trots att de får samma dos. En viktig orsak till detta är genetiskt betingade skillnader i uttryck av receptorer och aktiviteten av läkemedels-metaboliserande enzymer. Det finns för vissa läkemedel stora skillnader mellan olika populationer vilket skulle tala för olika dosering till olika etniska grupper men det finns också stora variationer mellan individer i en befolkning baserat på normal genetisk variation, så kallade single nucleotide polymorphisms (SNPs).

Målet för vår forskning är att hitta nya och bättre sätt att undvika onödiga biverkningar i samband med cytostatikabehandling. Jag studerar en grupp läkemedel som kallas för tiopuriner. Dessa används för behandling av leukemi hos barn, men även som behandling av inflammatorisk tarmsjukdom hos vuxna. Tiopurinerna omsätts i kroppen genom en rad enzymatiska reaktioner. Ett viktigt enzym i denna metabolism är tiopurinmetyltransferas (TPMT). I en svensk befolkning har ca 10% en nedsatt aktivitet av detta enzym. Kunskaper om den genetiska regleringen av tiopurinmetabolismen har öppnat nya möjligheter att individualisera behandlingen och fokus har sedan början av 80-talet legat på enzymet TPMT. Om dessa individer behandlas med konventionella tiopurindoser, löper de en hög risk för allvarliga biverkningar. I vårat laboratorium analyserar vi nivån av enzymet hos patienter som skall få tiopuriner, för att undvika att patienter ges för hög dos med biverkningar som följd (http://www.imh.liu.se/lakemedelsforskning/klinisk_farmakologi/tpmt-monitorering?l=sv).

I mina forskningsprojekt försöker jag förstå den genetiska regleringen av enzymet TPMT. Jag studerar om faktorer utanför genen har betydelse för hur mycket enzym som bildas, tex epigenetiska mekanismer såsom DNA metylering samt mikroRNA. Vi studerar även betydelsen av nya genetiska TPMT varianter som vi finner hos våra patienter.

I vår forskning är cancer-cellinjer ett viktigt redskap, på dessa celler kan vi undersöka verkningsmekanismen för och effektiviteten av cytostatika, vi kan selektivt stänga av gener som har betydelse för tiopurinmetabolismen och studera effekten av det. För att åstadkomma detta transfekterar vi celler med siRNA.

I ett samarbete med Astrid Lindgrens barnsjukhus studerar vi hur den åratal långa cytostatika behandlingen påverkar TPMT aktivitet hos barn med leukemi.

De metoder vi använder är;
o Realtids PCR för kvantifiering av genuttryck
o Pyrosequencing för detektion av kända genetiska förändringar i TPMT genen samt kvantifiering av DNA metylering
o Sekvensering med MegaBace
o Transfektion av cancer cell-linjer med siRNA och mikroRNA för att nedreglera genuttryck
o Western blot teknik för proteindetektion.

Vi har även metodik för att kvantifiera TPMT i nukleära celler (HPLC med radioaktiv detektor) och UV detektion för kvantifiering av tiopurinmetaboliter.
 

Malin Lindqvist Appells publikationer i DIVA (publikationsdatabas)